真的石花菜顔色有紫紅、深紅或绛紫色,在受多光的海區生長的往往呈淡黃色。新鮮的石花菜藻體色澤十分鮮豔。石花菜藻體直立叢生,羽狀分枝,互生或對生,枝呈扁平或亞柱形。藻體分枝很多,主枝生側枝,側枝上生小枝,各種分枝的末端尖形。整個藻體上部分枝較密,下部分枝較稀疏。石花菜藻體的基本構造可分為兩部分,即皮層和髓部。髓部由數十條平行縱列的長圓柱狀細胞所構成。皮層最外面一層細胞排列緊密,表面被有厚膜,細胞内有色素體,是進行光合作用的場所。石花菜生長屬于頂端生長,它的每一個分枝的頂端都有一個頂端細胞,由此進行多次分裂。
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