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綠藻中的氫化酶基因序列

生活 更新时间:2024-07-24 02:13:00

中國科學院南海海洋研究所熱帶海洋生物資源與生态重點實驗室海洋微生物代謝工程與生物合成研究團隊在海洋微生物氧雜蒽酮生物合成機制研究中取得新進展。9月14日,相關研究成果在線發表在《自然-通訊》(Nature Communications)上。

包含氧雜蒽酮骨架的天然産物具有抗炎、抗氧化、抑菌及抗腫瘤等多種活性。自四十多年前首次報道氧雜蒽酮類化合物以來,該類部分化合物已成為藥物研發的明星分子。目前,已發展了較多關于氧雜蒽酮類化合物的化學合成方法,但放線菌來源化合物的氧雜蒽酮骨架的生物合成過程和酶學機制尚不清楚。

研究團隊早期在海洋小單孢菌SCSIO N60中發現了Fluostatin C (7),與kinamycin A (11)同屬苯并芴類非典型角環素。前期,研究闡明fluostatin生物合成途徑中的黃素氧化酶FlsO2具有雙功能,能夠催化氧化和脫水反應,将8形成9(圖1)。基因缺失突變株△flsO2中仍可觀察到少量的化合物9,暗示基因簇中的其他氧化酶可能互補FlsO2的體内功能(Org. Lett.,2015, 17, 5324)。kinamycins生物合成研究表明單加氧酶AlpJ(FlsG同源蛋白)催化9的縮環反應形成苯并芴中間體12,黃素氧化酶AlpK可能負責12的C-5位羟化形成13。前期的體内研究也發現,AlpK的同源酶FlsO1具有類似的C-5位羟化功能(J. Org. Chem., 2021, 86, 11019)(圖1),但因化合物12不穩定而無法獲得,從而限制了FlsO1的體外功能研究。然而,研究獲得了nenestatin A生物合成中間體nenestatin C (14)(Org. Biomol. Chem., 2021,19, 4243),其結構與12類似,可作為12的模拟底物進行FlsO1的體外功能研究(圖1)。

基于上述工作,研究發現黃素氧化酶FlsO1能夠體外催化多元氧化反應,一方面可以催化前體8形成産物9,從而回補FlsO2的生理功能;另一方面可以将8轉化為多個産物,包括氧雜蒽酮化合物16和17(圖1)。此外,研究通過同位素标記、中間體或其衍生物的結構鑒定等實驗,闡釋了FlsO1通過催化三步級聯氧化反應(羟化、環氧化和Baeyer-Villiger氧化)形成氧雜蒽酮的反應機理(圖2);發現FlsO1能夠催化完成14(模拟生理底物12)的C-5羟基化,間接證明了FlsO1的生理功能;通過FlsO1酶的晶體結構、關鍵中間體的docking分析和氨基酸殘基定點突變實驗,揭示了FlsO1接受不同底物,催化多元氧化反應的結構基礎。

本研究發現了海洋放線菌中顯著不同于真菌和植物中氧雜蒽酮環的生物合成機制,闡明了多功能黃素氧化酶FlsO1催化多元氧化反應的結構基礎,拓展了黃素蛋白功能研究的視野,為氧雜蒽酮的結構多樣化和構效關系研究提供了新的工具酶和研究手段。研究工作得到國家自然科學基金、海南省重大科技計劃項目、國家重點研發計劃、王寬誠教育基金、中科院青年創新促進會、廣東省海洋經濟發展專項資金項目和南方海洋科學與工程廣東省實驗室(廣州)人才團隊引進重大專項等的支持。

綠藻中的氫化酶基因序列(海洋微生物氧雜蒽酮生物合成研究獲進展)1

圖1.多功能氧化酶FlsO1的生理功能和意外發現的新功能

綠藻中的氫化酶基因序列(海洋微生物氧雜蒽酮生物合成研究獲進展)2

圖2.FlsO1催化氧雜蒽酮環形成的酶學機制

來源:中國科學院南海海洋研究所

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