DAPI 是一種能夠與DNA強力結合的熒光染料。它結合到雙鍊DNA小溝的AT堿基對處,一個DAPI分子可以占據三個堿基對的位置。結合到雙鍊DNA上DAPI分子的熒光強度提高大約20倍,常用與熒光顯微鏡觀測,根據熒光的強度可以确定DNA的量。另外,因為DAPI可以透過完整的細胞膜,它可以用于活細胞和固定細胞的染色。
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