除同位素峰外(同位素天然豐度及豐度比可以參考Beynon表),某些重排反應也會産生M-1、M-2、M+1和M+2甚至更大質荷比的棒圖。大多數情況下确定分子離子峰是有一些規則可循的,有時還要結合一些特殊的、具體的情況來确定。構成分子離子峰有三個必要條件: 在質譜圖中一般是最高質量的離子;必須是一個奇電子離子;在高質量區,它能合理地丢失中性碎片而産生重要的碎片離子。
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