賬務處理系統的主要功能有賬套建立及賬套基本信息設置、會計科目設置、期初餘額設置、憑證制作 ( 含憑證的錄入、審核、查詢 )、憑證記賬 ( 過賬 )、賬薄查詢及打印 ( 包含各種樣式的明細賬、日記賬、往來賬 )、期末結賬等内容。
有的賬務處理系統還有出納現金及支票管理、銀行對賬及應收應付往來賬管理及數量、外币、部門、項目及預算等各種輔助核算的功能。
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