赤潮發生的物質基礎和首要條件是海水富營養化。赤潮發生的首要條件是赤潮生物增殖要達到一定的密度,否則,盡管其他因子都适宜,也不會發生赤潮,在正常的理化環境條件下,赤潮生物在浮遊生物中所占的比重并不大,有些鞭毛蟲類或者假藻類還是一些魚蝦的食物。但是由于特殊的環境條件,使某些赤潮生物過量繁殖,便形成赤潮。
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