亞硫酸的結構中硫原子周圍少了一個雙鍵氧原子,其它部分與硫酸相同,雙鍵氧原子的電負性比硫大,電子雲偏向氧一端,使硫原子附近帶有部分正電荷,羟基上的單鍵電子會向中心硫原子的方向移動,即更多地偏向羟基氧原子,而氫原子幾乎成了裸露的質子氫離子,在水分子的作用下,較容易發生電離,使得亞硫酸酸性弱于硫酸。
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