蛋白質二級結構是指多肽鍊主鍊原子的局部空間排布,不包括側鍊的構象。它主要有α-螺旋、β-折疊、β-轉角和無規卷曲四種。兩條以上肽鍊或一條肽鍊内的若幹肽段平行排列,通過鍊間羰基氧和亞氨基氫形成氫鍵,維持β-折疊構象的穩定。
1、α-右手螺旋類型:
α-螺旋為右手螺旋,每一圈含有3.6個aa殘基(或肽平面),每一圈高5.4Å。即每一個aa殘基上升1.5Å,旋轉了100度,直徑為5Å,2個二面角(ф,ψ)=(-570,-480)。
2、β-折疊類型:
肽鍊在空間的走向為鋸齒折疊狀,二面角(ф,ψ)=(-119℃,+113℃)。維持β-折疊的力量是折疊間的氫鍵;它産生于一個肽平面的C=O,與相鄰肽鍊的在空間上鄰近的另一個肽平面的N-H之間;兩條肽鍊上的肽平面互相平行,有平行式和反平行式兩種。
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