即使是最簡單的動物也是極其複雜的。像鳥類和哺乳動物這樣的高級脊椎動物是由許多深深交織在一起、相互依賴的活動部件組成的，非生物學家可能很難掌握。以下是大多數高等動物所共有的一些器官系統。

呼吸系統

呼吸系統

所有細胞都需要氧氣，這是從有機化合物中提取能量的關鍵成分。動物通過其呼吸系統從環境中獲得氧氣。陸栖脊椎動物的肺從空氣中收集氧氣，海栖脊椎動物的鰓從水中過濾氧氣，無脊椎動物的外骨骼促進氧氣（從水或空氣中）自由擴散到它們的體内。動物的呼吸系統還排洩二氧化碳，這是代謝過程中的一種廢物，如果讓它在體内積聚，将是緻命的。

循環系統

脊椎動物通過其循環系統向其細胞供應氧氣，循環系統是由動脈、靜脈和毛細血管組成的網絡，将含氧的血細胞輸送到它們身體的每一個細胞。高等動物的循環系統由心髒提供動力，這是一個密集的肌肉群，在一個生物的一生中會跳動數百萬次。

無脊椎動物的循環系統要原始得多；基本上，它們的血液在其小得多的體腔内自由擴散。

神經系統

神經系統是使動物能夠發送、接收和處理神經和感覺沖動，以及移動其肌肉的原因。在脊椎動物中，該系統可分為三個主要部分：中樞神經系統（包括大腦和脊髓）、周圍神經系統（從脊髓分支出來的較小的神經，将神經信号傳遞給遠處的肌肉和腺體）和自主神經系統（控制非自主活動，如心跳和消化）。

哺乳動物擁有最先進的神經系統，而無脊椎動物的神經系統則更為初級。

消化系統

動物需要将它們所吃的食物分解成其基本成分，以促進其新陳代謝。無脊椎動物有簡單的消化系統，一端進，另一端出（如蠕蟲或昆蟲的情況）。但所有脊椎動物都配備了一些口、喉、胃、腸和肛門或洩殖腔的組合，以及分泌消化酶的器官（如肝髒和胰腺）。反刍哺乳動物如牛有四個胃，以便有效地消化纖維性植物。

内分泌系統

在高等動物中，内分泌系統由腺體（如甲狀腺和胸腺）和這些腺體分泌的激素組成，它們影響或控制各種身體功能（包括代謝、生長和繁殖）。

要把内分泌系統與脊椎動物的其他器官系統完全區分開來可能很困難。例如，睾丸和卵巢（它們都與生殖系統密切相關）在技術上是腺體。胰腺也是如此，它是消化系統的一個重要組成部分。

生殖系統

從進化的角度看，生殖系統可以說是最重要的器官系統，它使動物能夠創造後代。無脊椎動物表現出廣泛的生殖行為，但底線是在這個過程中的某個時刻，雌性創造卵子，雄性使卵子受精，無論是内部還是外部。

所有脊椎動物--從魚到爬行動物再到人類--都有性腺，它是成對的器官，創造精子（在雄性）和卵子（在雌性）。大多數高等脊椎動物的雄性都有陰莖，雌性有陰道、分泌乳汁的乳頭和孕育胎兒的子宮。

淋巴系統

淋巴系統與循環系統密切相關，由遍布全身的淋巴結網絡組成，它們分泌和循環一種被稱為淋巴的透明液體（除了缺乏紅細胞和含有稍多的白細胞外，它與血液幾乎完全相同）。

淋巴系統隻存在于高等脊椎動物中，它有兩個主要功能：保持循環系統對血液中血漿成分的供應和維持免疫系統。在低等脊椎動物和無脊椎動物中，血液和淋巴通常是結合在一起的，不是由兩個獨立的系統來處理。

肌肉系統

肌肉是使動物既能運動又能控制其動作的組織。肌肉系統有三個主要組成部分：骨骼肌（使高等脊椎動物能夠行走、奔跑、遊泳和用手或爪子抓取物體），平滑肌（參與呼吸和消化，不受意識控制），以及心肌或心髒肌（為循環系統提供動力）。

一些無脊椎動物，如海綿，完全沒有肌肉組織，但由于上皮細胞的收縮，仍然可以移動。

免疫系統

在這裡列出的所有系統中，免疫系統可能是最複雜和技術最先進的，它負責将動物的本地組織與病毒、細菌和寄生蟲等外來體和病原體區分開來。它還負責調動免疫反應，即由身體制造各種細胞、蛋白質和酶來消滅入侵者。

免疫系統的主要載體是淋巴系統。這兩個系統隻在脊椎動物中或多或少地存在，而且在哺乳動物中最為先進。

骨骼系統

高等動物由數萬億個分化的細胞組成，因此需要某種方式來維持其結構的完整性。許多無脊椎動物（如昆蟲和甲殼類動物）有由甲殼素和其他堅韌的蛋白質組成的外部身體覆蓋物，稱為外骨骼。鲨魚和鳐魚是由軟骨固定在一起的。脊椎動物由鈣和各種有機組織組成的内部骨骼--稱為内骨骼--支撐。

許多無脊椎動物完全沒有任何種類的外骨骼或内骨骼。可以考慮軟體的水母、海綿和蠕蟲。

泌尿系統

所有陸生脊椎動物都會産生氨，這是消化過程中的一種副産品。在哺乳動物和兩栖動物中，這種氨變成尿素，由腎髒處理，與水混合，并作為尿液排出體外。

有趣的是，鳥類和爬行動物與它們的其他廢物一起以固體形式分泌尿素。這些動物在技術上有泌尿系統，但它們不産生液體尿液。魚類直接從體内排出氨氣，而不是首先将其轉化為尿素。

皮膚系統

肢體系統包括皮膚和覆蓋皮膚的結構或生長物（鳥類的羽毛、魚類的鱗片、哺乳動物的毛發等），以及爪子、指甲、蹄子等。肢體系統最明顯的功能是保護動物免受環境的危害，但它也是溫度調節（毛發或羽毛的塗層有助于保存身體内部的熱量）、保護動物免受捕食者的傷害（烏龜的厚殼使它成為鳄魚的難啃的點心）、感知疼痛和壓力以及在人類中甚至産生維生素D等重要生化物質所不可或缺的。

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