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dna病毒的基因組結構

健康 更新时间:2025-02-10 09:55:58

複旦大學及四川大學合作發現非洲豬瘟病毒易錯DNA連接酶的關鍵位點殘基

iNature:非洲豬瘟病毒(ASFV)具有傳染性,可引起豬的高緻命性疾病。ASFV DNA連接酶(AsfvLIG)是迄今為止發現的最易出錯的連接酶之一,它催化ASFV DNA修複過程中的DNA連接反應,在病毒基因組的誘變中起着重要作用。

2019年1月23日,複旦大學甘建華,李繼喜及四川大學/佐治亞州立大學Huang Zhen共同通訊等在Nature Communications 上發表題為“Structure of the error-prone DNA ligase of African swine fever virus identifies critical activesite residues”的文章,報道了四個獨特的活性位點殘基(AD結構域的Asn 153和Leu 211;OB結構域的Leu 402和Gln 403)對AsfvLIG的催化效率至關重要。

dna病毒的基因組結構(科學家發現非瘟病毒DNA連接酶關鍵位點殘基)1

非洲豬瘟病毒(ASFV)是一種雙鍊DNA病毒,具有高度的傳染性,可在家豬和野豬中引起緻命的疾病。ASFV基因組的大小在170到190 kb之間,編碼150多個蛋白質,這些蛋白質參與了ASFV生命周期的各個階段,包括基因表達、DNA複制、病毒組裝、進入宿主細胞和抑制宿主免疫應答。AsfvLIG由419個氨基酸組成,是迄今發現的最小的DNA連接酶之一。AsfvLIG在中心有一個腺苷化結構域(AD),在C端有一個OB折疊結構域(OB);AD和OB結構域在同源蛋白中都是保守的。除了AD和OB結構域外,許多DNA連接酶都有一個DNA結合域(DBD),這對于底物結合和連接過程至關重要,而AsfvLIG的N端區域(NTD)與其他連接酶DBD結構域沒有相似之處。

dna病毒的基因組結構(科學家發現非瘟病毒DNA連接酶關鍵位點殘基)2

AsfvLIG的結構示意圖

AsfvLIG包含四個獨特的殘基,包括AD域的Asn 153和Leu 211,以及OB結構域的Leu 402和Gln 403。雖然他們不參與直接催化過程,這些殘基可能與其相應的NTD或DBD結構域協同工作,這些位點殘基對缺口的識别和催化效率有着重要的意義。

該文章發現的4種獨特的結構特征可以作為小分子設計的潛在靶點,這可能會損害ASFV的基因組修複,并有助于今後對抗這種病毒。

該項目得到了國家自然科學基金(31870721,31470724,31670878,21572146,21761132029)和中國重點研發項目(2016YFA0500600),四川省重點研發項目(2018NZ0151)資助項目。

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