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總蛋白計算方法

科技更新时间:2024-12-20 16:05:35

UniProt（全稱Universal Protein），它整合了三大數據（Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD ）的數據。是目前信息最豐富、資源最廣的免費蛋白質數據庫。

首先看一下主頁，大緻分為5個部分， 1、UniProtKB；2、UniRef；3、UNIParc；4、Proteomics；5、Supporting data。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）1

UniProtKB（Universal Protein Knowledge base）它是經過專家校驗的數據集

以小鼠基因BCL2為例，簡單介紹一下數據庫功能。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）2

點擊search後，進入數據庫，左側是基因蛋白數據相關信息，包括功能、亞細胞定位、參與通路、組織表達、互作蛋白、結構與功能域等等。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）3

蛋白在細胞内定位

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）4

蛋白參與的生物學過程,同時數據庫提供了氨基酸修飾位點以及參與的轉錄後修飾過程。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）5

蛋白的三級結構以及内含的模體結構與位置以及包含的功能域。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）6

UniProtKB（Universal Protein Knowledge base）它是經過專家校驗的數據集

以小鼠基因BCL2為例，簡單介紹一下數據庫功能。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）7

二．主頁上方有五個選項，分别是BLAST、Align、Download、Add to basket、History.

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）8

1.BLAST: 這個按鈕可以讓你用感興趣的蛋白質序列做BLAST分析，輸入基因序列

搜索哪些蛋白質的氨基酸序列與你感興趣的蛋白質相同或相似，預測這個蛋白具有哪些生物系功能以及蛋白的空間結構。

2.Align:以讓你對多個蛋白質的序列之間進行相似性比對，方便找到蛋白之間的結構保守區域，根據蛋白質的相似性，分析蛋白間的親緣關系，進化的先後順序等。

3.Download：下載蛋白的序列數據，支持FASTA，Text，Excel，XML，List等。

4. Add to basket:将感興趣的蛋白質加入以備後期使用。

5. History:查詢曆史。

總蛋白計算方法（蛋白數據知多少）9

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