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科學家已解讀百分之八十dna

生活 更新时间:2024-12-22 20:31:45

科學家已解讀百分之八十dna(古DNA實驗如何減少背景污染)1

本次研究的實驗設計和數據分析。 中科院古脊椎所 供圖

中新網北京1月9日電 (記者 孫自法)近年來,随着古DNA研究技術迅速發展,不同古DNA實驗方案在實際應用中産生的背景污染情況有何不同?古DNA實驗如何盡可能地減少背景污染?這方面的議題備受關注。

中國科學院古脊椎動物與古人類研究所(中科院古脊椎所)1月9日發布消息說,該所分子古生物學實驗室付巧妹研究員團隊最新完成關于不同古DNA實驗方案中相關實驗室背景污染物的系統評估,結果表明,水、土壤、空氣和人體皮膚等環境都是實驗室背景污染的潛在來源。

同時,采用單鍊DNA文庫構建實驗方案與機器人自動化液相處理相結合的方式可以顯著降低背景微生物的多樣性,減少實驗中可能産生的背景污染。

這項古DNA實驗領域的重要研究成果論文,近日在線發表于學術期刊《科學通報》(Science Bulletin)。中科院古脊椎所聯合培養博士生苗波是論文第一作者,付巧妹研究員和劉逸宸副研究員為論文共同通訊作者。

付巧妹指出,古DNA技術及實驗的廣泛應用,極大提高了古DNA研究的效率。不過,目前尚不清楚不同實驗方案在實際應用中産生的背景污染情況,這一直是古DNA領域面臨的巨大挑戰之一。

此前,科研團隊通過對低生物量微生物組研究中存在的污染進行梳理,并對微生物組研究中井間污染的量化研究表明,實驗室中的樣本污染是來自井間交叉污染和背景污染的組合,不同實驗室的污染程度不同,不同的實驗方案在井間交叉污染的發生情況和水平上存在差異。然而,關于實驗室中樣本污染仍存在“不同實驗方案的背景污染情況是怎樣的”“不同實驗方案的組合應用如何來盡可能地減少背景污染”等需要探究的問題。

在本次開展的針對性研究中,科研團隊利用在超淨實驗室中,以不同實驗方案處理的40個陰性對照樣品的鳥槍測序宏基因組數據進行詳細分析,探究超淨實驗室的背景污染情況,并對實驗中盡可能地減少背景污染進行探讨。結果表明,水、土壤、空氣和人體皮膚等環境都是實驗室背景污染的潛在來源;采用單鍊DNA文庫構建實驗方案與機器人自動化液相處理相結合的方式,可顯著降低背景微生物的多樣性,減少實驗中可能産生的背景污染。

付巧妹表示,這項研究可為評估古DNA實驗方案的污染情況提供參考,特别是為高度降解樣本的自動化處理實驗方案進行系統評估提供出新的見解。(完)

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