食猿雕每年10~12月開始營巢,大多選擇生長在山谷斜坡的大樹,将巢築在附生在大樹上的蕨類植物形成的平台之中,距地面的高度一般在30米左右。每窩僅産1枚卵,孵化期大約為2個月。雄鳥送給雌鳥和雛鳥的食物頻次是不同的。在食物貧乏的情況下,由于雄鳥帶給正在孵卵的雌鳥的食物太少,雌鳥不得不離開巢和卵,自己去捕食,這種情況往往會導緻孵化失敗而最終棄巢。
在自然狀态下,食猿雕的繁殖率極低,不僅産卵的數目太少,而且哺育一隻幼鳥要花2年時間。因為幼鳥長齊羽毛需要4個多月,而且即使已經長齊了羽毛的幼鳥,仍然要在親鳥的領域中逗留到第二年。幼鳥在自己學習捕食技術的期間内,可能仍然需要親鳥的喂養。所以隻有當幼鳥離開親鳥的領域之後,親鳥才可能再次營巢,進行繁殖。隻有在幼鳥很小就夭折了的情況下,親鳥才在當年冬天繼續營巢繁殖。
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