根據《千島湖魚類資源》裡記載,千島湖内共有包括青魚、草魚、鲢魚、鳙魚等共114種魚類,其中鯉形目有71種,約占總類的百分之六十二;鲈形目有23種,約占百分之二十點一;鮎形目11種,約占百分之九;鲟形目和胡瓜魚目各2種,各占百分之一點七五;合鰓魚目、鳗鲡目和青鳉目等5目,各有魚類1種,各占百分之零點八八。
在千島湖114種魚類中,最多的魚種為花白鲢,最珍貴的魚種為鳜魚。
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