DNA存在于細胞核(細菌的DNA在拟核,病毒的DNA在蛋白質外殼内)、線粒體、葉綠體中。
DNA分子的雙螺旋結構是相對穩定的,這是因為在DNA分子雙螺旋結構的内側,通過氫鍵形成的堿基對,使兩條脫氧核苷酸長鍊穩固地并聯起來。另外,堿基對之間縱向的相互作用力也進一步加固了DNA分子的穩定性。
各個堿基對之間的這種縱向的相互作用力叫做堿基堆集力,它是芳香族堿基π電子間的相互作用引起的。現在普遍認為堿基堆集力是穩定DNA結構的最重要的因素。再有,雙螺旋外側負電荷的磷酸基團同帶正電荷的陽離子之間形成的離子鍵,可以減少雙鍊間的靜電斥力,因而對DNA雙螺旋結構也有一定的穩定作用。
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