起始密碼子一般有3-4種,分别是AUG、編碼真核生物中的甲硫氨酸和原核生物中的N-甲酰甲硫氨酸(fMet),GUG(缬氨酸)或AUA(異亮氨酸)、UUG(亮氨酸)等也用作起始密碼子(少數生物中)。
起始密碼子是指信使RNA分子中每相鄰的三個核苷酸編成一組,在蛋白質合成時,代表某一種氨基酸的規律。信使RNA在細胞中能決定蛋白質分子中的氨基酸種類和排列次序。信使RNA分子中的四種核苷酸(堿基)的序列能決定蛋白質分子中的20種氨基酸的序列。而在信使RNA分子上的三個堿基能決定一個氨基酸。
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