DNA變性是指核酸雙螺旋堿基對的氫鍵斷裂,堿基間的堆積力遭到破壞,雙鍊變成單鍊,使核酸的天然構象和性質發生改變,但不涉及其一級結構的改變。
凡能破壞雙螺旋穩定的因素(如加熱、極端的pH、有機試劑如甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等)均可引起核酸分子變性。
變性後的DNA常發生一些理化及生物學性質的改變:①溶液黏度降低。DNA雙螺旋是緊密的剛性結構,變性後則是柔軟而松散的無規則單股線性結構,DNA黏度因此而明顯下降。②溶液旋光性發生改變。變性後整個DNA分子的對稱性及分子局部的構象改變,使DNA溶液的旋光性發生變化。③增色效應。
DNA變性用于檢測兩個不同的DNA序列之間之序列差異。将DNA加熱和變性成單鍊狀态,并将該混合物冷卻使可以重新進行雜交。雜交分子的相似序列中如果互補序列有差異,則會導緻堿基配對中斷。在基因組範圍中,該方法已被用于估算兩物種之間遺傳距離的研究,稱為DNA-DNA雜交。在其中的單個分區的DNA,變性梯度凝膠和溫度梯度凝膠可用于檢測此兩個序列,此法稱為溫度梯度凝膠電泳,為表現較小差異時使用的方法。
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