硝化系統是硝化反應系統的簡稱,指硝化細菌将氨氧化為亞硝酸鹽,或将亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽的反應系統,負責執行這項任務的硝化細菌,分别是亞硝酸菌及硝酸菌,在有氧氣存在時,首先由亞硝酸菌把氨氧化為亞硝酸鹽,其次由硝酸菌再把亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽,硝化反應在氮循環水質淨化中起着相當重要的角色。
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