金魚的腮位于口咽腔兩側,由鰓弓、鰓耙、鰓絲組成。每一條鰓的兩側又生出許多突起為鰓小片,能增大與水的接觸面,提高氣體交換效率,中間分布的大量微血管,是血液與水環境進行氣體交換的場所。當水由金魚口進入流經鰓,然後經鰓蓋後緣流出,水流經過鰓絲時,水中的溶解氧進入鰓絲的毛細血管中,而二氧化碳由鰓絲排放到水中,二者進行氣體交換,金魚進行呼吸。
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