1、頭部:大鳄的頭比較尖,小鳄龜的頭比較圓;
2、上颌:大鳄龜上颌似鷹嘴狀,鈎大,小鳄龜上颌似鈎狀,但鈎小;
3、嘴部:大鳄龜的嘴部比小鳄龜的要長,舌頭為紅色的結構,口腔底部有一蠕蟲樣的附器,常靜伏水中,張着嘴,借附器誘食附近魚類,小鳄龜則沒有這些特征;
4、背甲:大鳄龜的背甲甲峰很明顯,而小鳄龜的甲峰則不明顯,近乎平背,背甲看起來比較圓。大鳄龜的背甲上有3條凸起的縱走棱脊,褐色,每塊盾片均有突起物,腹甲棕色,具上緣盾,小鳄龜的背甲棕黃色或黑褐色,有3條縱行棱脊,肋盾略隆起。
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