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seer數據庫是怎麼檢測的

科技更新时间:2024-09-27 13:24:55

經常收到朋友提問，SEER裡面有基因數據嗎？有腫瘤标志物嗎？有免疫組化嗎？

答案是有的，不過數量有限，而且不是很明顯，新手确實不好找到。

如果能靈活應用，就可以為自己的研究增色不少

先來安利幾篇SEER數據庫，含有這些“特殊變量”的文章

① 研究直腸癌的文章，納入了癌胚抗原CEA

seer數據庫是怎麼檢測的（SEER裡的那些特殊變量）1

② 研究肝癌的文章，納入甲胎蛋白 AFP

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③研究口腔舌癌的文章，納入神經侵犯 perineural invasion

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SEER數據庫的特殊變量在哪裡？

就是我們下載數據的時候，出現的這些SSF1，SSF2。。。SSF20等變量

但是我們要知道分别代指什麼

SSF：site specific factor

SEER Stat 軟件裡位置如下，直接下載即可

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SSF替換

參考 SSFs.Released.v205.Nov2016.xls

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說明：并非每一種癌症都有可用SSF等指标

而且，同一種SSF在不同癌種裡面，對應内容也不一樣

比如SSF1，在乳腺癌裡代表ER狀态，在食管胃結合部癌，則代表區域淋巴結檢查結果

通過該文件，能夠得到SSF對應指标名稱，但是對于後續數據整理，具體數值變換沒有幫助

這時候需要使用 CS_Coding_Instructions_V0205.exe 這一軟件

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比如這裡，000代表未做檢查，010代表ER( )，020代表ER(-)

做乳腺癌的同學，能夠把ER, PR, HER2指标納入進去，文章一定增色不少

文示例文獻：

1.Tan Y, Fu D, Li D, et al. Predictors and Risk Factors of Pathologic Complete Response Following Neoadjuvant Chemoradiotherapy for Rectal Cancer: A Population-Based Analysis. Front Oncol. 2019;9:497. Published 2019 Jun 13. doi:10.3389/fonc.2019.00497

2.Berger NG, Tanious MN, Hammad AY, et al. External radiation or ablation for solitary hepatocellular carcinoma: A survival analysis of the SEER database. J Surg Oncol. 2017;116(3):307–312. doi:10.1002/jso.24661

3.Goodman M, Liu L, Ward K, et al. Invasion characteristics of oral tongue cancer: frequency of reporting and effect on survival in a population-based study. Cancer. 2009;115(17):4010–4020. doi:10.1002/cncr.24459

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獲取配套軟件，及配合文件，關注同名微信公衆号“臨床預測模型訓練營”，後台回複"SEER-01"即可

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也可微信掃碼，進入預測模型科研交流群，關于SEER數據庫，R語言，易侕軟件操作，問題讨論，經驗交流為主~

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